磁力棒去除鐵屑雜質，主要是通過磁源和漿料接觸除掉冷卻液中的鐵雜質。但是由于磁力棒是由不銹鋼皮和磁鐵組成，一直都是帶著磁性的，我們沒有辦法控制它的磁性功能。在清洗磁力棒時，它也是帶著磁性的，因此在清洗時需要克服磁力棒的磁性吸附力。
由于磁力棒必須要帶磁清洗，給了很多廠家帶來很大的麻煩，吸附在磁力棒上的鐵屑雜質即使用高壓水沖洗也不一定能徹底清洗，另外，常常使用高壓水沖洗會加速磁力棒退磁，因此，只能采用人工來清洗。對于工廠來說，磁力棒的數量實在太多了，成百上千支的磁力棒要用人工清洗要耗費很多的人力和時間。

除了人工清洗，市場上還有一種全自動磁力棒清洗機，可以將磁力棒分為帶磁區和非帶磁區，它將磁力棒上的鐵雜質推到沒有磁力的非帶磁區，缺少了磁性吸附力，只要用少量的水清洗就可以完全清除鐵雜質了。